FMT (fecal microbiota transplantation, czyli przeszczep mikrobioty jelitowej) to metoda, w której wprowadza się mikrobiotę od odpowiednio przebadanego dawcy w celu przywrócenia prawidłowej różnorodności bakteryjnej jelit. Obecnie znajduje zastosowanie przede wszystkim w leczeniu nawracających zakażeń jelitowych, a jej potencjalne korzyści w innych obszarach zdrowia są przedmiotem intensywnych badań.